Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP15Q9Y4E8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
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