Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELP3Q9H9T3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms