Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms