Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHOXF2Q9BQY4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOXF2Q9BQY4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms