Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MALSU1Q96EH3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms