Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GNPDA2Q8TDQ7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms