Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYRIPQ8NFW9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms