Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC112Q8NEF3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms