Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCL2Q8N4E4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms