Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GDPD3Q7L5L3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GDPD3Q7L5L3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDPD3Q7L5L3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDPD3Q7L5L3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDPD3Q7L5L3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDPD3Q7L5L3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDPD3Q7L5L3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDPD3Q7L5L3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDPD3Q7L5L3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDPD3Q7L5L3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDPD3Q7L5L3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDPD3Q7L5L3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDPD3Q7L5L3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDPD3Q7L5L3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDPD3Q7L5L3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDPD3Q7L5L3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDPD3Q7L5L3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDPD3Q7L5L3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms