Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CSAG1Q6PB30 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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