Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf135Q5VTT2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms