Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATAD3CQ5T2N8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms