Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COL5A1-AS1Q5SY13 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
COL5A1-AS1Q5SY13 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms