Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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