Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.97e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.837e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.767e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.642e-8■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.436e-11■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.287e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 RAB40C-212ENST00000569575 692 ntTSL 223.03■■□□□ 1.287e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 RAB40C-209ENST00000565511 783 ntTSL 322.15■■□□□ 1.147e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 PKMYT1-202ENST00000382240 1991 ntTSL 221.29■■□□□ 16e-11■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 16e-11■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.977e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.957e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.946e-11■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.937e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.96e-11■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.96e-11■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 APBB3-219ENST00000511896 2032 ntTSL 219.65■□□□□ 0.747e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.727e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 MZF1-208ENST00000600048 1409 ntTSL 1 (best)19.44■□□□□ 0.77e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.697e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.676e-11■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.557e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 RAB40C-207ENST00000563109 710 ntTSL 318.48■□□□□ 0.557e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.557e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.497e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.467e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 ZMIZ2-204ENST00000416856 616 ntTSL 517.94■□□□□ 0.463e-9■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 PKMYT1-219ENST00000575981 910 ntTSL 217.81■□□□□ 0.446e-11■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 OSBP2-210ENST00000445781 559 ntTSL 417.8■□□□□ 0.447e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.422e-8■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.417e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 APBB3-215ENST00000510241 2801 ntTSL 217.07■□□□□ 0.327e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 RAB40C-210ENST00000566290 753 ntTSL 317.05■□□□□ 0.327e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 E4F1-203ENST00000563643 793 ntTSL 316.84■□□□□ 0.296e-8■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 APBB3-212ENST00000506289 943 ntTSL 516.79■□□□□ 0.287e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 E4F1-205ENST00000564930 297 ntTSL 316.66■□□□□ 0.262e-12■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.264e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.257e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 TBC1D17-207ENST00000599049 1742 ntTSL 516.53■□□□□ 0.247e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.226e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.217e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 APBB3-206ENST00000467078 1920 ntTSL 1 (best)16.35■□□□□ 0.217e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 NAA50-204ENST00000478020 473 ntTSL 416.3■□□□□ 0.22e-8■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 NAA50-205ENST00000481432 958 ntTSL 316.18■□□□□ 0.182e-8■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 FKBP8-205ENST00000596494 439 ntTSL 316.18■□□□□ 0.187e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 NAA50-202ENST00000467022 520 ntTSL 416.18■□□□□ 0.182e-8■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 AHCY-204ENST00000480653 2211 ntTSL 216.09■□□□□ 0.174e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.167e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.167e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.157e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.157e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 APBB3-214ENST00000509914 2020 ntTSL 1 (best)15.89■□□□□ 0.137e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 C9orf78-204ENST00000461762 2390 ntTSL 215.86■□□□□ 0.137e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.126e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 SMARCA4-219ENST00000592604 2940 ntTSL 1 (best)15.6■□□□□ 0.097e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.097e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 DHX38-205ENST00000564307 785 ntTSL 415.6■□□□□ 0.097e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.063e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.057e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.057e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 USP36-210ENST00000588086 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.31■□□□□ 0.047e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 OSBP2-213ENST00000453621 895 ntTSL 515.27■□□□□ 0.047e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 TBC1D17-203ENST00000594984 1441 ntTSL 515.23■□□□□ 0.033e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 PNPLA7-203ENST00000434090 2419 ntTSL 515.14■□□□□ 0.017e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.017e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.017e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 USP36-214ENST00000589225 5885 ntTSL 1 (best)15.11■□□□□ 0.017e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 APBB3-221ENST00000515056 2064 ntTSL 215.04■□□□□ -07e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 CAPN1-213ENST00000527897 879 ntTSL 314.73□□□□□ -0.057e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 FKBP8-208ENST00000597611 966 ntTSL 314.7□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.066e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 RAB40C-202ENST00000509637 565 ntTSL 314.65□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.17e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 C9orf78-205ENST00000480023 2143 ntTSL 214.23□□□□□ -0.137e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.132e-8■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 AGPAT1-207ENST00000476663 746 ntTSL 514.19□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 MFN2-204ENST00000484391 294 ntTSL 313.97□□□□□ -0.177e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 OSBP2-206ENST00000431368 3050 ntTSL 513.94□□□□□ -0.187e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.187e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.187e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 PLXNB2-208ENST00000463165 3038 ntTSL 213.9□□□□□ -0.187e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 MFN2-206ENST00000497302 645 ntTSL 213.78□□□□□ -0.27e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.217e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.213e-8■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.217e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 INTS6L-203ENST00000481908 3528 ntTSL 213.59□□□□□ -0.237e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 TBC1D17-205ENST00000596243 2831 ntTSL 1 (best)13.17□□□□□ -0.37e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.317e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 ESYT1-203ENST00000547667 594 ntTSL 213□□□□□ -0.337e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 SMARCA4-208ENST00000585799 3842 ntTSL 212.93□□□□□ -0.347e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 MZF1-204ENST00000595245 3261 ntTSL 512.9□□□□□ -0.347e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 DUS2-206ENST00000564975 833 ntTSL 212.81□□□□□ -0.365e-9■■■■■ 38.1
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