Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID5AQ03989 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID5AQ03989 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID5AQ03989 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID5AQ03989 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID5AQ03989 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID5AQ03989 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID5AQ03989 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID5AQ03989 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID5AQ03989 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID5AQ03989 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID5AQ03989 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID5AQ03989 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID5AQ03989 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID5AQ03989 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID5AQ03989 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID5AQ03989 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID5AQ03989 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID5AQ03989 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID5AQ03989 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID5AQ03989 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms