Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP27A1Q02318 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms