Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms