Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELLP55199 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELLP55199 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELLP55199 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELLP55199 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELLP55199 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELLP55199 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELLP55199 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELLP55199 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELLP55199 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELLP55199 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms