Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME1P48163 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME1P48163 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME1P48163 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME1P48163 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME1P48163 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME1P48163 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME1P48163 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME1P48163 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME1P48163 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME1P48163 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME1P48163 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME1P48163 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME1P48163 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME1P48163 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ME1P48163 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME1P48163 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME1P48163 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME1P48163 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME1P48163 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME1P48163 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME1P48163 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME1P48163 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME1P48163 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME1P48163 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME1P48163 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME1P48163 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME1P48163 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME1P48163 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME1P48163 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME1P48163 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME1P48163 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME1P48163 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME1P48163 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME1P48163 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME1P48163 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME1P48163 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME1P48163 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME1P48163 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME1P48163 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME1P48163 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME1P48163 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME1P48163 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ME1P48163 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME1P48163 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME1P48163 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ME1P48163 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME1P48163 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME1P48163 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME1P48163 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME1P48163 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME1P48163 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME1P48163 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ME1P48163 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ME1P48163 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ME1P48163 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ME1P48163 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ME1P48163 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ME1P48163 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ME1P48163 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ME1P48163 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ME1P48163 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ME1P48163 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME1P48163 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME1P48163 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME1P48163 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME1P48163 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME1P48163 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ME1P48163 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME1P48163 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms