Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCSHP14314 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCSHP14314 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms