Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
J3KT08 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
J3KT08 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
J3KT08 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
J3KT08 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms