Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4DEV8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DEV8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DEV8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DEV8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms