Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RDH8Q9NYR8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms