Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 SH3YL1-219ENST00000473104 2463 ntTSL 1 (best)10.19□□□□□ -0.788e-9■■□□□ 12.2
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AGGF1Q8N302 SH3YL1-217ENST00000472012 863 ntTSL 38.92□□□□□ -0.988e-9■■□□□ 12.2
AGGF1Q8N302 SH3YL1-215ENST00000468321 2739 ntTSL 1 (best)8.63□□□□□ -1.038e-9■■□□□ 12.2
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AGGF1Q8N302 MAP4-206ENST00000423088 899 ntTSL 38.16□□□□□ -1.19e-7■■□□□ 12.2
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AGGF1Q8N302 RANBP1-210ENST00000435265 1879 ntTSL 219.85■□□□□ 0.772e-8■■□□□ 12.2
AGGF1Q8N302 RANBP1-207ENST00000423859 832 ntTSL 317.86■□□□□ 0.452e-8■■□□□ 12.2
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AGGF1Q8N302 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.082e-8■■□□□ 12.2
AGGF1Q8N302 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.112e-8■■□□□ 12.2
AGGF1Q8N302 RANBP1-211ENST00000448394 688 ntTSL 214.19□□□□□ -0.142e-8■■□□□ 12.2
AGGF1Q8N302 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.182e-8■■□□□ 12.2
AGGF1Q8N302 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.222e-8■■□□□ 12.2
AGGF1Q8N302 LIMS1-203ENST00000393310 4392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.142e-8■■□□□ 12.2
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AGGF1Q8N302 IDE-206ENST00000478361 3198 ntTSL 1 (best)6.36□□□□□ -1.391e-13■■□□□ 12.2
AGGF1Q8N302 IDE-208ENST00000496903 1867 ntTSL 25.37□□□□□ -1.551e-13■■□□□ 12.2
AGGF1Q8N302 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.771e-13■■□□□ 12.2
AGGF1Q8N302 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.941e-13■■□□□ 12.2
AGGF1Q8N302 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.721e-10■■□□□ 12.2
AGGF1Q8N302 PTBP2-209ENST00000482253 2029 ntTSL 219.25■□□□□ 0.671e-10■■□□□ 12.2
AGGF1Q8N302 PTBP2-201ENST00000370197 3057 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.921e-10■■□□□ 12.2
AGGF1Q8N302 PTBP2-202ENST00000370198 3054 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.031e-10■■□□□ 12.2
AGGF1Q8N302 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.051e-10■■□□□ 12.2
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AGGF1Q8N302 PTBP2-204ENST00000459735 791 ntTSL 57.85□□□□□ -1.151e-10■■□□□ 12.2
AGGF1Q8N302 PTBP2-206ENST00000462433 365 ntTSL 26.04□□□□□ -1.441e-10■■□□□ 12.2
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AGGF1Q8N302 PTBP2-210ENST00000492905 776 ntTSL 1 (best)5.75□□□□□ -1.491e-10■■□□□ 12.2
AGGF1Q8N302 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.851e-10■■□□□ 12.2
AGGF1Q8N302 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.314e-13■■□□□ 12.2
AGGF1Q8N302 NRBP1-202ENST00000356442 585 ntTSL 38.22□□□□□ -1.093e-8■■□□□ 12.2
AGGF1Q8N302 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.83■□□□□ 0.938e-12■■□□□ 12.2
AGGF1Q8N302 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.318e-12■■□□□ 12.2
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AGGF1Q8N302 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.064e-8■■□□□ 12.1
AGGF1Q8N302 SEPT5-207ENST00000431044 3173 ntTSL 1 (best)17.01■□□□□ 0.314e-8■■□□□ 12.1
AGGF1Q8N302 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.624e-6■■□□□ 12.1
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AGGF1Q8N302 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.084e-6■■□□□ 12.1
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AGGF1Q8N302 TRAK1-206ENST00000449246 3260 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.394e-6■■□□□ 12.1
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AGGF1Q8N302 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.495e-6■■□□□ 12.1
AGGF1Q8N302 RNASET2-207ENST00000478180 963 ntTSL 517.73■□□□□ 0.435e-6■■□□□ 12.1
AGGF1Q8N302 RNASET2-202ENST00000358165 2445 ntTSL 217.18■□□□□ 0.345e-6■■□□□ 12.1
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AGGF1Q8N302 RNASET2-208ENST00000496851 881 ntTSL 510.02□□□□□ -0.815e-6■■□□□ 12.1
AGGF1Q8N302 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.861e-7■■□□□ 12.1
AGGF1Q8N302 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.021e-7■■□□□ 12.1
AGGF1Q8N302 NPM1-208ENST00000521672 597 ntTSL 58.05□□□□□ -1.121e-7■■□□□ 12.1
AGGF1Q8N302 NPM1-205ENST00000518587 670 ntTSL 27.47□□□□□ -1.211e-7■■□□□ 12.1
AGGF1Q8N302 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.381e-7■■□□□ 12.1
AGGF1Q8N302 PRPF3-204ENST00000470824 898 ntTSL 25.98□□□□□ -1.452e-6■■□□□ 12.1
AGGF1Q8N302 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.75e-6■■□□□ 12.1
AGGF1Q8N302 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.795e-6■■□□□ 12.1
AGGF1Q8N302 RPL4-209ENST00000565723 408 ntTSL 38.62□□□□□ -1.032e-28■■□□□ 12
AGGF1Q8N302 GOLGA4-204ENST00000429018 2036 ntTSL 1 (best)16.23■□□□□ 0.192e-6■■□□□ 12
AGGF1Q8N302 NSUN6-206ENST00000493816 315 ntTSL 38.09□□□□□ -1.112e-17■■□□□ 12
AGGF1Q8N302 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.983e-7■■□□□ 12
AGGF1Q8N302 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.32e-11■■□□□ 12
AGGF1Q8N302 TPR-208ENST00000492973 453 ntTSL 29.03□□□□□ -0.962e-11■■□□□ 12
AGGF1Q8N302 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.092e-11■■□□□ 12
AGGF1Q8N302 CCDC32-208ENST00000559153 1918 ntTSL 1 (best)12.73□□□□□ -0.372e-11■■□□□ 12
AGGF1Q8N302 CCDC32-214ENST00000561011 1577 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.382e-11■■□□□ 12
AGGF1Q8N302 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.462e-11■■□□□ 12
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