Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC70Q6NSX1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC70Q6NSX1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms