Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTF1Q16619 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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