Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.329e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 RRM1-203ENST00000526350 583 ntTSL 25.93□□□□□ -1.469e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LMBR1L-215ENST00000550815 541 ntTSL 45.63□□□□□ -1.519e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 RRM1-204ENST00000526865 562 ntTSL 44.69□□□□□ -1.669e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.684e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.719e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.764e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 RRM1-211ENST00000532710 549 ntTSL 43.51□□□□□ -1.859e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SMARCB1-208ENST00000634926 269 ntTSL 1 (best)3.3□□□□□ -1.883e-10■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LCMT1-213ENST00000577157 522 ntTSL 33.04□□□□□ -1.929e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SMARCB1-209ENST00000635578 242 ntTSL 1 (best)1.52□□□□□ -2.173e-10■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.189e-7■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 TGM2-205ENST00000469269 3467 ntTSL 210.94□□□□□ -0.669e-7■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 EIF4G1-237ENST00000485712 474 ntTSL 420.57■□□□□ 0.881e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SLC9A3R1-203ENST00000578958 714 ntTSL 219.51■□□□□ 0.711e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 IGF2R-203ENST00000475584 597 ntTSL 316.9■□□□□ 0.31e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CDK12-209ENST00000584632 4165 ntTSL 513.49□□□□□ -0.251e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.071e-6■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 SLC13A5-201ENST00000293800 3176 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.731e-6■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.16e-7■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.286e-7■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 MDH2-201ENST00000315758 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.446e-7■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 MCM3-202ENST00000419835 2523 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.348e-10■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 MCM3-203ENST00000421471 1030 ntTSL 511.03□□□□□ -0.648e-10■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 MCM3-201ENST00000229854 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.88e-10■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 MCM3-205ENST00000596288 3169 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.968e-10■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 MCM3-207ENST00000616552 3208 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.978e-10■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 DNM1-209ENST00000493925 728 ntTSL 318.55■□□□□ 0.566e-13■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 DNM1-215ENST00000631179 357 ntTSL 310.13□□□□□ -0.796e-13■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 DNM1-220ENST00000636201 100 ntTSL 53.79□□□□□ -1.86e-13■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.528e-7■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 PCBP2-222ENST00000552296 1342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.825e-10■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 HUWE1-202ENST00000262854 14739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.769e-7■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.369e-7■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.569e-7■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.982e-8■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 BLOC1S5-TXNDC5-201ENST00000439343 3030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.282e-8■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.141e-7■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 STT3A-216ENST00000534472 1561 ntTSL 1 (best)20.33■□□□□ 0.842e-7■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 STT3A-210ENST00000527606 569 ntTSL 417.12■□□□□ 0.332e-7■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.072e-7■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 STT3A-201ENST00000392708 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.832e-7■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 STT3A-206ENST00000526213 555 ntTSL 27.85□□□□□ -1.152e-7■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.32e-7■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 STT3A-212ENST00000529886 542 ntTSL 46.39□□□□□ -1.392e-7■■■□□ 18.1
PCBP1Q15365 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.418e-7■■■□□ 18
PCBP1Q15365 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.791e-13■■■□□ 18
PCBP1Q15365 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.541e-13■■■□□ 18
PCBP1Q15365 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.391e-13■■■□□ 18
PCBP1Q15365 YJEFN3-202ENST00000458210 2785 ntTSL 216.22■□□□□ 0.191e-13■■■□□ 18
PCBP1Q15365 CYC1-204ENST00000533444 1832 ntTSL 1 (best)28.41■■■□□ 2.143e-7■■■□□ 18
PCBP1Q15365 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.483e-7■■■□□ 18
PCBP1Q15365 HGH1-205ENST00000533266 2106 ntTSL 222.92■■□□□ 1.261e-6■■■□□ 18
PCBP1Q15365 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.931e-6■■■□□ 18
PCBP1Q15365 HGH1-206ENST00000534255 1791 ntTSL 1 (best)17.93■□□□□ 0.461e-6■■■□□ 18
PCBP1Q15365 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.192e-10■■■□□ 18
PCBP1Q15365 PRKAR1A-217ENST00000589228 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.472e-10■■■□□ 18
PCBP1Q15365 PRKAR1A-201ENST00000358598 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.612e-10■■■□□ 18
PCBP1Q15365 PRKAR1A-211ENST00000586397 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.882e-10■■■□□ 18
PCBP1Q15365 PRKAR1A-214ENST00000588188 1209 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.92e-10■■■□□ 18
PCBP1Q15365 PRKAR1A-202ENST00000392710 3551 ntTSL 27.66□□□□□ -1.182e-10■■■□□ 18
PCBP1Q15365 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.232e-10■■■□□ 18
PCBP1Q15365 PRKAR1A-221ENST00000592800 1036 ntTSL 26.85□□□□□ -1.312e-10■■■□□ 18
PCBP1Q15365 PRKAR1A-212ENST00000586541 570 ntTSL 56.15□□□□□ -1.422e-10■■■□□ 18
PCBP1Q15365 CD46-214ENST00000480003 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.721e-6■■■□□ 18
PCBP1Q15365 CD46-202ENST00000322918 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.881e-6■■■□□ 18
PCBP1Q15365 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.071e-6■■■□□ 18
PCBP1Q15365 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.071e-6■■■□□ 18
PCBP1Q15365 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.081e-6■■■□□ 18
PCBP1Q15365 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.121e-6■■■□□ 18
PCBP1Q15365 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.21e-6■■■□□ 18
PCBP1Q15365 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.21e-6■■■□□ 18
PCBP1Q15365 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.211e-6■■■□□ 18
PCBP1Q15365 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.211e-6■■■□□ 18
PCBP1Q15365 CD46-212ENST00000469535 7826 ntTSL 1 (best)7.1□□□□□ -1.271e-6■■■□□ 18
PCBP1Q15365 CD46-217ENST00000493796 408 ntTSL 55.41□□□□□ -1.541e-6■■■□□ 18
PCBP1Q15365 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.722e-6■■■□□ 18
PCBP1Q15365 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.251e-6■■■□□ 18
PCBP1Q15365 ANXA11-205ENST00000438331 6965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.491e-6■■■□□ 18
PCBP1Q15365 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.511e-6■■■□□ 18
PCBP1Q15365 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.112e-6■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.062e-6■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 ENO2-209ENST00000538763 1646 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.242e-6■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.352e-6■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 CHP1-205ENST00000560411 1088 ntTSL 1 (best)16.1■□□□□ 0.177e-24■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 CHP1-207ENST00000560784 717 ntTSL 514.11□□□□□ -0.157e-24■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 CHP1-209ENST00000561280 572 ntTSL 413.06□□□□□ -0.327e-24■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 CHP1-202ENST00000392151 1000 ntTSL 213.06□□□□□ -0.327e-24■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 CHP1-203ENST00000558351 766 ntTSL 512□□□□□ -0.497e-24■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 CHP1-204ENST00000560397 568 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.657e-24■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 ENO2-210ENST00000539713 543 ntTSL 418.03■□□□□ 0.484e-6■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 ENO2-207ENST00000537688 547 ntTSL 517.58■□□□□ 0.44e-6■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 ENO2-212ENST00000542509 825 ntTSL 515.61■□□□□ 0.094e-6■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 ENO2-206ENST00000536199 823 ntTSL 514.92□□□□□ -0.024e-6■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 ENO2-208ENST00000537838 541 ntTSL 414.61□□□□□ -0.074e-6■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 KHSRP-203ENST00000594745 379 ntTSL 315.98■□□□□ 0.155e-8■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.57e-7■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.636e-7■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.196e-7■■■□□ 17.9
PCBP1Q15365 GNAI2-206ENST00000446079 2086 ntTSL 1 (best)15.86■□□□□ 0.136e-7■■■□□ 17.9
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