Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMCO1Q147U7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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