Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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GBX1Q14549 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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GBX1Q14549 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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GBX1Q14549 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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GBX1Q14549 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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GBX1Q14549 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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GBX1Q14549 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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GBX1Q14549 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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GBX1Q14549 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GBX1Q14549 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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