Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms