Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F1Q01094 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms