Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAMQ00059 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAMQ00059 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms