Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNNI3P19429 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms