Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CIZ1Q9ULV3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms