Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCLQ9NW38 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms