Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ARFGAP3Q9NP61 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms