Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms