Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6AQ9H2E6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms