Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHOXF2Q9BQY4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms