Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT7

TUBGCP6, Gamma-tubulin complex component 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP6Q96RT7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBGCP6Q96RT7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBGCP6Q96RT7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBGCP6Q96RT7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBGCP6Q96RT7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBGCP6Q96RT7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBGCP6Q96RT7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBGCP6Q96RT7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBGCP6Q96RT7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBGCP6Q96RT7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP6Q96RT7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP6Q96RT7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP6Q96RT7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP6Q96RT7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP6Q96RT7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP6Q96RT7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP6Q96RT7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP6Q96RT7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP6Q96RT7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP6Q96RT7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP6Q96RT7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP6Q96RT7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP6Q96RT7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP6Q96RT7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP6Q96RT7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP6Q96RT7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP6Q96RT7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP6Q96RT7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms