Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms