Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPTE2Q6XPS3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPTE2Q6XPS3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms