Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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