Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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BRD3Q15059 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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BRD3Q15059 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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BRD3Q15059 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRD3Q15059 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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BRD3Q15059 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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BRD3Q15059 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
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BRD3Q15059 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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BRD3Q15059 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
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BRD3Q15059 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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