Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ODF1Q14990 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms