Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM29Q14134 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
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TRIM29Q14134 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
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TRIM29Q14134 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM29Q14134 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM29Q14134 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM29Q14134 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM29Q14134 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM29Q14134 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM29Q14134 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM29Q14134 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM29Q14134 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM29Q14134 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM29Q14134 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM29Q14134 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM29Q14134 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM29Q14134 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM29Q14134 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM29Q14134 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM29Q14134 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM29Q14134 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM29Q14134 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM29Q14134 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM29Q14134 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM29Q14134 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM29Q14134 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM29Q14134 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM29Q14134 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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