Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA1SQ13698 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1SQ13698 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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