Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms